ダックシャトル改のコントロールポッドが使用不能となり、バン、ヒロ、ランの３人はミゼルトラウザーへ直接乗り込むことを決意する。全人類の希望を彼ら３人に託し、メンバーと各国のLBXプレイヤーはグランドスフィアを必死で守る。一方、ミゼルトラウザーへの侵入に成功したバンたちの前に、ミゼルオーレギオンが姿を現す！ パーフェクトワールドを創りだすためバンたちを完全排除しようとするミゼル。ついに、世界とLBXを守るため、ミゼルオーレギオンとのLBXバトルが始まった！